MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015184	CGA	2	6	26460	26465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168308
502	NC_015184	GCCA	2	8	26491	26498	25 %	0 %	25 %	50 %	325168308
503	NC_015184	TCA	2	6	26506	26511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168308
504	NC_015184	ACC	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_015184	ATT	2	6	26587	26592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015184	CTA	2	6	26643	26648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015184	CAG	2	6	26695	26700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015184	AG	3	6	26699	26704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015184	AGG	2	6	26723	26728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015184	T	6	6	26772	26777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015184	GGC	2	6	26781	26786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015184	AGC	2	6	26875	26880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015184	GAA	2	6	26914	26919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015184	ATC	2	6	26940	26945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168309
515	NC_015184	GAT	2	6	26990	26995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168309
516	NC_015184	CCTG	2	8	26999	27006	0 %	25 %	25 %	50 %	325168309
517	NC_015184	CAT	2	6	27030	27035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168309
518	NC_015184	TCG	2	6	27083	27088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168309
519	NC_015184	GA	3	6	27097	27102	50 %	0 %	50 %	0 %	325168309
520	NC_015184	TTC	2	6	27172	27177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168309
521	NC_015184	GGC	2	6	27189	27194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168309
522	NC_015184	AAT	2	6	27197	27202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168309
523	NC_015184	CGG	2	6	27278	27283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015184	AAG	2	6	27344	27349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015184	GCG	2	6	27353	27358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015184	CCAC	2	8	27430	27437	25 %	0 %	0 %	75 %	325168310
527	NC_015184	TGGG	2	8	27499	27506	0 %	25 %	75 %	0 %	325168310
528	NC_015184	AGC	2	6	27517	27522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168310
529	NC_015184	TCA	2	6	27558	27563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168310
530	NC_015184	AGGCGA	2	12	27573	27584	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325168310
531	NC_015184	AAT	2	6	27601	27606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015184	TCA	2	6	27766	27771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015184	TCG	2	6	27843	27848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015184	GCGCC	2	10	27873	27882	0 %	0 %	40 %	60 %	325168311
535	NC_015184	TTC	2	6	27919	27924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168311
536	NC_015184	ACA	2	6	27943	27948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168311
537	NC_015184	CT	3	6	28002	28007	0 %	50 %	0 %	50 %	325168311
538	NC_015184	GCCT	2	8	28026	28033	0 %	25 %	25 %	50 %	325168311
539	NC_015184	ATC	2	6	28051	28056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168311
540	NC_015184	AGG	2	6	28068	28073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015184	GTC	2	6	28127	28132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015184	GTT	2	6	28240	28245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168312
543	NC_015184	TAG	2	6	28247	28252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168312
544	NC_015184	CTG	2	6	28261	28266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
545	NC_015184	GGC	2	6	28321	28326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168312
546	NC_015184	GCT	2	6	28398	28403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
547	NC_015184	CGC	2	6	28439	28444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168312
548	NC_015184	TGC	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
549	NC_015184	GCC	2	6	28502	28507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168312
550	NC_015184	GAC	2	6	28549	28554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168312
551	NC_015184	GTC	2	6	28571	28576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
552	NC_015184	GATG	2	8	28593	28600	25 %	25 %	50 %	0 %	325168312
553	NC_015184	GAGGG	2	10	28607	28616	20 %	0 %	80 %	0 %	325168312
554	NC_015184	CGT	2	6	28623	28628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
555	NC_015184	GCT	2	6	28656	28661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
556	NC_015184	GCC	2	6	28696	28701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168312
557	NC_015184	GC	3	6	28816	28821	0 %	0 %	50 %	50 %	325168312
558	NC_015184	GC	3	6	28838	28843	0 %	0 %	50 %	50 %	325168312
559	NC_015184	CAT	2	6	29007	29012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168312
560	NC_015184	GC	3	6	29039	29044	0 %	0 %	50 %	50 %	325168312
561	NC_015184	GAT	2	6	29061	29066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168312
562	NC_015184	AGC	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168312
563	NC_015184	CAGGG	2	10	29105	29114	20 %	0 %	60 %	20 %	325168312
564	NC_015184	TCA	2	6	29228	29233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168312
565	NC_015184	TCG	2	6	29255	29260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168312
566	NC_015184	CTC	2	6	29299	29304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168312
567	NC_015184	GC	3	6	29306	29311	0 %	0 %	50 %	50 %	325168312
568	NC_015184	GACG	2	8	29317	29324	25 %	0 %	50 %	25 %	325168312
569	NC_015184	TG	3	6	29325	29330	0 %	50 %	50 %	0 %	325168312
570	NC_015184	CGG	2	6	29374	29379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015184	CGGT	2	8	29652	29659	0 %	25 %	50 %	25 %	325168313
572	NC_015184	GGAT	2	8	29663	29670	25 %	25 %	50 %	0 %	325168313
573	NC_015184	TCC	2	6	29745	29750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168313
574	NC_015184	ACG	2	6	29751	29756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168313
575	NC_015184	CACC	2	8	29775	29782	25 %	0 %	0 %	75 %	325168313
576	NC_015184	TGC	2	6	29808	29813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
577	NC_015184	CGG	2	6	29822	29827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
578	NC_015184	CCG	2	6	29859	29864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168313
579	NC_015184	CGCT	2	8	29873	29880	0 %	25 %	25 %	50 %	325168313
580	NC_015184	GCG	2	6	29907	29912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
581	NC_015184	CGA	2	6	29922	29927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168313
582	NC_015184	AGGGG	2	10	29968	29977	20 %	0 %	80 %	0 %	325168313
583	NC_015184	GCG	2	6	30053	30058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
584	NC_015184	CAACG	2	10	30064	30073	40 %	0 %	20 %	40 %	325168313
585	NC_015184	CCA	2	6	30078	30083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168313
586	NC_015184	CG	3	6	30157	30162	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
587	NC_015184	CGA	2	6	30166	30171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168313
588	NC_015184	GCG	2	6	30177	30182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
589	NC_015184	TGC	2	6	30183	30188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
590	NC_015184	TGC	2	6	30213	30218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
591	NC_015184	GCA	2	6	30262	30267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168313
592	NC_015184	CGGC	2	8	30280	30287	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
593	NC_015184	TGC	2	6	30292	30297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
594	NC_015184	CCT	2	6	30301	30306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168313
595	NC_015184	GC	3	6	30330	30335	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
596	NC_015184	GCC	2	6	30341	30346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168313
597	NC_015184	ATCGCG	2	12	30390	30401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168313
598	NC_015184	GCT	2	6	30409	30414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
599	NC_015184	GGC	2	6	30436	30441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
600	NC_015184	GC	3	6	30482	30487	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
601	NC_015184	CGT	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
602	NC_015184	TTGA	2	8	30542	30549	25 %	50 %	25 %	0 %	325168313
603	NC_015184	TGG	2	6	30585	30590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168313
604	NC_015184	CGC	2	6	30609	30614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168313
605	NC_015184	GGC	2	6	30616	30621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
606	NC_015184	GCG	2	6	30622	30627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
607	NC_015184	GGGGAG	2	12	30661	30672	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	325168313
608	NC_015184	AGA	2	6	30868	30873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168314
609	NC_015184	CTG	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168314
610	NC_015184	TCCG	2	8	30940	30947	0 %	25 %	25 %	50 %	325168314
611	NC_015184	CT	3	6	30977	30982	0 %	50 %	0 %	50 %	325168314
612	NC_015184	GTCT	2	8	31019	31026	0 %	50 %	25 %	25 %	325168314
613	NC_015184	CCG	2	6	31056	31061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168314
614	NC_015184	TCG	2	6	31091	31096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168314
615	NC_015184	CTTG	2	8	31159	31166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015184	GA	3	6	31172	31177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015184	CGAG	2	8	31195	31202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015184	CTT	2	6	31211	31216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015184	TCAG	2	8	31232	31239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_015184	ACGA	2	8	31257	31264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_015184	TTG	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168315
622	NC_015184	TGA	2	6	31332	31337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168315
623	NC_015184	CGT	2	6	31362	31367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
624	NC_015184	GGC	2	6	31390	31395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168315
625	NC_015184	TCA	2	6	31400	31405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168315
626	NC_015184	TGC	2	6	31477	31482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
627	NC_015184	GCC	2	6	31483	31488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168315
628	NC_015184	CTG	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
629	NC_015184	CAA	2	6	31560	31565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
630	NC_015184	GGT	2	6	31663	31668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168315
631	NC_015184	CCCA	2	8	31722	31729	25 %	0 %	0 %	75 %	325168315
632	NC_015184	CG	3	6	31735	31740	0 %	0 %	50 %	50 %	325168315
633	NC_015184	TCG	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
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639	NC_015184	CAA	2	6	32181	32186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
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645	NC_015184	ACA	2	6	32372	32377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
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650	NC_015184	TGC	2	6	32572	32577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
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663	NC_015184	CTT	2	6	33110	33115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168316
664	NC_015184	GGA	2	6	33147	33152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168316
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758	NC_015184	GGC	2	6	38452	38457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168321
759	NC_015184	CCG	2	6	38608	38613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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761	NC_015184	GA	3	6	38684	38689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
762	NC_015184	CCAA	2	8	38719	38726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
763	NC_015184	AAG	2	6	38807	38812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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767	NC_015184	CTA	2	6	38926	38931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_015184	CGC	2	6	39050	39055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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770	NC_015184	TTC	2	6	39177	39182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168322
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878	NC_015184	GGCT	2	8	44135	44142	0 %	25 %	50 %	25 %	325168324
879	NC_015184	TCT	3	9	44165	44173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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881	NC_015184	AGAT	2	8	44201	44208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
882	NC_015184	AG	3	6	44239	44244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
883	NC_015184	TAG	2	6	44283	44288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
884	NC_015184	GCATC	2	10	44304	44313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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